サイトの全体設定と記載されますが、ここだけですべてが決定付けられるわけではありません...

まずは、各メニューを理解し、対処するとしましょう
サイトオプションの一番左ですね
サイト全体の設定メニュー

file拡張子
...htmlがデフォルト指定ですが、phpで進められる例もありますが、知る方はそれで
行けますが、ウェブ初期段階の方は無理に使うことはございません..
ていうか、使わなくとも何ら不自由はないでしょう...
やりたい方のみ...でよいのでは？

文字コード
...shift-jisがデフォルト　
日本文字対応がshift-jisとされているようですが、ワールドプレスなどは
UTF-８が主体
（UTF-８）に変更も可能
海外scriptを多く取り込むなどの場合、UTF-８でなければ反応しないこともありますね..
導入したとたん文字化けになったら...原因はそれと理解ください..
UTF-８に切り替えれば、解消します..

当サイトは、海外scriptが多く取り込んでいるのでUTF-８にしてますが、他では
shift-jis仕様もありますね...
ま、script導入しないまでも（UTF-８）に切り替えておられる例は多々ございますので
選択は自己判断に委ねます..

URLをリンクに置き換え
...通常は、しないが標準
するに指定すると、HTML関連記事等など作成した際は、記事内に置く...
例リンクコードでさえ自動リンクされてしまう...
参照　シリウス機能リンクの置き換えの注意ごと

RSS/サイトマップの作成....
サイトマップページの生成...サイトのメニューマップ
...サイト内ページを案内する
ページが多くなるとサブカテゴリーやエントリーをサイドバーで一覧表示
しきれない理由で非表示にしますが、隠れた見えないページを読者に
理解してもらう機能です

ウェブ上のサイトには、サイトマップなるリンクがどこかしらに付随されていると
理解しますが、サイト内にあるすべてのページメニューが一覧表示で確認できると
いうものです

サイトURLのwww統一
...ドメインの頭にwwwを付けるかの指定

ウェブ上を拝見するとwww付きのサイトよく見かけますね
wwwあり、なしどちらが良いのか？
見た目はありが良いかもしれませんね
検索効果もよいとか言われていますが、そんなこともございません
ま、自己判断で...

サイト内検索
...ヘッダー内に検索窓を付けるかの指定

アクセス解析の位置....　
いじらずともそのままで、head内に自動挿入されます
置き場はここがベスト..です

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